В.Н. Бочарников принимал участие в Международной глобальной программе «Оценка экосистем тысячелетия» и Глобальной оценке состояния биоразнообразия пресноводных экосистем крупнейших рек мира, а также является одним из основных российских авторов сводного доклада по биоразнообразию лесов России.